Anaerob kultivering av mikroorganismer
Miljø uten fritt oksygen utgjør en stor del av biosfæren, og inkluderer så forskjellige steder som tykktarmen hos pattedyr og oljereservoar. Disse miljøene domineres av obligat anaerobe og fakultative aerobe bakterier og archaea. Mange obligat anaerobe mikroorganismer dør selv ved kun en kort/lav eksponering for oksygen. Spesielle teknikker er nødvendige for å påvise, kvantifisere og dyrke disse mikroorganismene.
|
SINTEF har et velutstyrt laboratorium for dyrking av obligat anaerobe mikroorganismer, samt lang erfaring på området. Vi har spesielt fokusert på termofile prokaryoter i oljereservoarer, men studier og analyser relatert til næringsmiddelmikrobiologi er også utført. Vi er også i gang med molekylærbiologiske studier av obligat anaerobe bakterier.
Utstyret inkluderer:
- Mark 3 Anaerob arbeidsbenk (bildet) som gjør det mulig å benytte mange av de samme arbeidsmetodene for anaerobe mikroorganismer som de som benyttes for aerobe mikroorganismer: for eksempel petriskåler med agarmedium og plukking av enkeltkolonier for å etablere rene kulturer.
- Reduksjonskolonne for fjerning av restmengder av oksygen fra nitrogen og andre gasser, og påfølgende deokygenering av buffere og media. |
 |
- Anaerobbokser som muliggjør anaerob og mikroaerofil inkubasjon av petriskåler fra -2 til 95ºC
- Anaerobbokser som tillater overtrykk (opp til 0,7 bar) og kan fylles med en definert atmosfære, for eksempel H2 + CO2.
- Fluorescensmikroskop (Leica DMBL) med 10x, 20x, 40x, 63 x og 100x objektiver og type A, D, I3 og Y3 fluorescensfiltre. Utstyrt med DC300 digitalt fotosystem.
- Stereomikroskop (Leica MZ8), 6-100x forstørring. Velegnet for undersøkelser av de små og fargeløse koloniene som mange anaerobe mikroorganismer danner.
- Flow cytometer (Becton Dickinson FACScan). Kan blant annet brukes til å telle antall celler og å skille mellom levende og døde celler.
- Gasskromatograf (Agilent 3000A Micro GC) for analyse av sammensetningen av atmosfæren over anaerobe kulturer.
|
Laboratoriet er godkjent for arbeid med klasse 2 mikroorganismer.
Stoffskifteprodukter (metabolitter) og andre bestanddeler av interesse fra anaerobe mikroorganismer kan identifiseres og kvantifiseres i Analyselaboratoriet, mens anaerobe mikroorganismer som ikke dør ved en kortere eksponering for O2 kan undersøkes for spesielle egenskaper i Screening-laboratoriet.
